Contributions to Zoology, 84 (2) – 2015

Experimental systematics: sensitivity of cladistic methods to polarization and character ordering schemes

Valentin Rineau1, Anaïs Grand2, René Zaragüeta3, Michel Laurin4

1.  UMR 7207 CR2P, Sorbonne Universités, CNRS/MNHN/UPMC, Muséum national d’Histoire naturelle, Bâtiment de Géologie, Case postale 48, 43 rue Buffon, F-75231 Paris cedex 05, France

2.  Service du patrimoine naturel, Muséum national d’Histoire naturelle, Bâtiment reptiles et amphibiens, 25 rue Cuvier, 75005 Paris, France

3.  UMR 7205 ISYEB, CNRS/MNHN/UPMC/EPHE, Muséum national d’Histoire naturelle, Bâtiment de Géologie, Case postale 48, 43 rue Buffon, F-75231 Paris cedex 05, France

4.  UMR 7207 CR2P, Sorbonne Universités, CNRS/MNHN/UPMC, Muséum national d’Histoire naturelle, Bâtiment de Géologie, Case postale 48, 43 rue Buffon, F-75231 Paris cedex 05, France. E-mail: laurin@mnhn.fr

Keywords: Branch length,evolutionary model,hierarchy,ordered characters,outgroup polarization,parsimony,reversals,three-taxon analysis,three-taxon statements,unordered characters.